mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGCTTGATCTAACCATGTG CATGGTTCCGTCAAGCGCCAGG CGGCTGTCTCTTGTGCTTGATCTAACCATGTGGCCCCGCCTATTGTGACATCACATGGTTCCGTCAAGCGCCAGGGACCGCTG 3 0 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-218 1e-40 tni-mir-218a-1 1e-39 -43.3 ((((.((((((.(((((((((..((((((((((...(((.....)))...))))))))))..))))))))).)))))).)))) (-43.30)