mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTAGGGGCAGCTGT CAGCAAGAAAAGTGAGGGACTTTTAGGGGCAGCTGTGTTTTATTAACCCAGTCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCAATTGTCAAC 4 1 3' arm Fugu_rubripes mirbase mir-365 3e-41 tni-mir-365 3e-47 -39.7 ..((((((..((((((((..(((((((((((((((.(((.....))).)))).....))))))))))).))))))))..)))))).......... (-39.70)