mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTCTGGTAATGCCGT AGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGA CCTGTTGATAGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGATGTAATTATTGTTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCAT 2 3 3' arm Fugu_rubripes mirbase 100 tni-mir-429 8e-38 -27 ......(((.(((((..(((((((((..((((((((..........))))))))..)))))))))))))))))... (-27.00)