mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGCCCTTGGACTACATCG ATGCAGTCCATGGGCATATACA CCCTGGTGTGAGGGTATGTGCCCTTGGACTACATCGTGGAAGCCAGCACCATGCAGTCCATGGGCATATACACTTGCCTCATGG 3 0 5' arm Fugu_rubripes mirbase mir-455 7e-39 gga-mir-455 1e-40 -41.5 ((.(((.(..((.((((((((((.((((((.(((.(((........))).))).)))))).)))))))))).))..).))).)) (-41.50)