mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAGCTCTTTAAATGGTACTGC AGCGCCATTTTCAGAGCTATCA TGCAGACAGCAGCGCCATTTTCAGAGCTATCAGTCAACGTGGTCATAGCTCTTTAAATGGTACTGCTGTAGGCAC 4 0 3' arm Fugu_rubripes mirbase mir-458 6e-36 tni-mir-458 6e-20 -36.3 (((..(((((((..((((((..((((((((...((.....))..))))))))..))))))..)))))))..))). (-36.30)