mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGACATCATATGTACGGCTGC GGTCGTATGCATGACGTCATTTA CTTCTGATACTGGTGGTGGCTTGGTGGTCGTATGCATGACGTCATTTACTTCGATGATTGGAGTGACATCATATGTACGGCTGCTAAACTGCTACAAGAGAC 5 0 3' arm Fugu_rubripes mirbase mir-489 3e-35 tni-mir-489 2e-42 -39.3 .........((.((((..(.((((..(((((((..((((.(((((((...((...))...))))))).))))..)))))))..)))).)..)))).)).... (-39.30)