mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTGTTTGGCTATG TATTATATCTACCCTAAGAGGGACTTACATGAAGAGGAAGAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATTATTTGCTCATGTTCATGCTCACCGGTTTCCTTGCCGGCAAGTTGTGTTTGGCTATGTTTTGCTCTCTTCTTCTCATGTAAGTGCCACTTAGGACCAATTGTTGG TCACATGACATGATGCAAGAAATAAATGCAGCATATAATATTATATCTACCCTAAGAGGGACTTACATGAAGAGGAAGAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATTATTTGCTCATGTTCATGCTCACCGGTTTCCTTGCCGGCAAGTTGTGTTTGGCTATGTTTTGCTCTCTTCTTCTCATGTAAGTGCCACTTAGGACCAATTGTTGGATCACCAGGAAGCCCTTCACTTGCATGATGAGGTCCAAATTACCCATGATATATTTTTTTGGAAATTGTACT 2 0 5' arm Glycine_max mirnest MIR169_2 0.000003 gma-MIR169a 3e-64 -74.1 ............((((((.((.((((((((((.(((((((((((...((((.(((((((.((((((((((((((.........((..........)).............)))))))))))))).))))))).))))...))))))))))))))))))))).)).)))))).((((...)))) (-74.1)