mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC TGTGCTCTGCAGTGTGAGGTAGTTGGTTGTATGGTTTCGCATAATAAACAGCACGGAGATAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCCTGCGGAGTCAC 4 0 5' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase let-7 3e-29 fru-let-7d 1e-49 -37.91 .(((((((((((.(.(((.(((..((((((((((((((...................)).))))))))))))..))).))).).)))))))).))) (-37.91)