mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGAAAGGGGAATAGCAGTTG ACTGCTATTCCCATTTCTAAA TGTGAAGTTGAATTGCTATTCAACTGCTATTCCCATTTCTAAACCTTGTTACACGAGCATCTTGATCAATGGTCTAGAAAGGGGAATAGCAGTTGAGTGGTGCTTCAACGATAA AGCTTGCAGCTGCCGTCCGTGCACAGAGGAGTCTTAGGAGGAACAACTGTAGAGAAAAGGATCTGCCAAATTCGCTAGAAAATTCACCAGAAACACCACCCGTTATCCAATTAAACCAGATTTTTGGACCATTTGTGAAGTTGAATTGCTATTCAACTGCTATTCCCATTTCTAAACCTTGTTACACGAGCATCTTGATCAATGGTCTAGAAAGGGGAATAGCAGTTGAGTGGTGCTTCAACGATAAGTTATTGGATTTAGTATTTATCTTAGCCTGTTTTCGTGTACTTTGTTTTGCCGGATGGAGGTATGTGATTTTGTCTATGATTCTTGATACAATAACCTACACTTACTCTCATTGATGGTTTGTGCAGATCTAATAGCTATGAAGCATCGATACCGGACACGACACGGTCACGTGACACATGTAATGTCTAAAATATTAAAATATAGAACGTAATACGAGTGTCGTGTTGGTGTTGGACACTGATAGGGACGCGTGTCAGACACCGGACACGACAAGGGACTGAAATGTTCATGCTTCATAGTCTAATAGAATCGTTTATGTTTGAGATCTTGTTGATGAGAGGCAGATAGAGGTCAACTTGCCAATATGATAACCTACAGTTCTATATTAGATGCTTTTTGCAAAACGATCATCCAAAGCTATTGGATTATTCAGAAACTAAGACAAGAGTCAAACCGCTATGTACACA 1 0 3' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR1508b 6e-49 -50.7 ......((((((.(((((((((((((((((((((.((((((.((((((...((.((...)).))..))).))).)))))).))))))))))))))))))))).))))))..... (-50.7)