mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGAGCTGTGTTTCTGTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTTAAATACCTGTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAGAAAT 3 0 5' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-9 4e-28 fru-mir-9-3 2e-41 -33.9 ........(((((((..(((((((((((((((.(((((((((...))))...))))).)))))))))))))))..))))))) (-33.90)