mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGAGAACCGAATGTA GGGTTAGTTTTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTTTATGTAATATCATAAAGCTAGAGAACCGAATGTACAAACTAATTCC 3 0 5' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-9 3e-22 fru-mir-9-4 1e-40 -33.1 ((((((((((.(((.(((((((.(((((((.(((((............))))).))))))).))))))).))).)))))))))). (-33.10)