mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGTAACAGCCTCACT TGTCTGGATTGGAAGTCTACAAAGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAGCTGAAGAAGAGTGTTAAATGCTAACCCTTACTAGGTCATGCTGTAACAGCCTCACTCCTTCCTATTTGGGGACCCAGTACAGTA GGGCCCTCAAGCTCAAGCTAGCCCCTCCTTCATTCTTTACCACTTCCTCCTTCTTTCCTAGCTTACTTACAAGTGTTAAAAAAATGTAATCAGCATAGCATGCATGCACCTTCTTCCTTAATTTTTCTTTAAGGTTTCCAACCCTATCTTAATTAATTATGTTATTTAAGTTACGTACATGCTCTTCTCATTTTTCCAATCCACTTGCTTTTAAATATGCAACACACAAGTCTTCTCCAAGCTTTAAGTGTGCAAACACTCCATTTGGGTGGTGTTCTATATATCTTTTTGTGGTTCAGGAAGTGTGTTGCAATGTTTCTTTTCTTCTTTTAAGCGTAGTAGCTCACATATATGCACCTGCAGAGATAGTGGAATTGAGCCGAACATGCATAAACTGTCTGGATTGGAAGTCTACAAAGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTTTGGTTAGAGAGCTGAAGAAGAGTGTTAAATGCTAACCCTTACTAGGTCATGCTGTAACAGCCTCACTCCTTCCTATTTGGGGACCCAGTACAGTAGTAGATTCTTCAACAATCTGAAAGACACACAACGCTTAAAAAGCAAAAGGTAAGAAGTTAGTGGGCATGAGAAAACCACTGTTAGCATCGTATATTCCTTCTTTAT 2 2 5' arm Glycine_max mirnest MIR167_1 1e-20 gma-MIR167a 2e-31 -53 ...(((.(((((..((((.((((((((..(((((.((((.(((((((((((((((((((((....))))))))..(((.((((.....)))).))).)))))))))))))...)))).)))))..)))))..))).))))))))).))).. (-53)