mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAACATGATCTT GTCATCCTTGCAGCTTCAAT CTTTATGCTGATTTGAGAGATTGAAGCTGCCAACATGATCTTGGTGATGCCAAACTGGGTCGCCTGTGTCTGATTGTCCATATATGAGTGGACAATGTCAAGGCTCTATACATAGGCAAATGGCCGGGCGTGTGTTTTTGGTGATGTGTTCGTATCTGTTCATGGGTTGAGAAAGGAGAGGTTAACCAGGTCATCCTTGCAGCTTCAATCACTCATGCCCAACAATT TTTACTCTAGTTTGAGGTCTCTAATCATTTTCTAGCCAAACAAAGAACATCTTTTAAGCAAATGGTTGAATCTTGGTGCACCATGATGTCCGCCTGTCTTGTTCATGGAGTACTTTTCTTTATGCTGATTTGAGAGATTGAAGCTGCCAACATGATCTTGGTGATGCCAAACTGGGTCGCCTGTGTCTGATTGTCCATATATGAGTGGACAATGTCAAGGCTCTATACATAGGCAAATGGCCGGGCGTGTGTTTTTGGTGATGTGTTCGTATCTGTTCATGGGTTGAGAAAGGAGAGGTTAACCAGGTCATCCTTGCAGCTTCAATCACTCATGCCCAACAATTTTTCGTACAAAGCAAATATGAAGAAAATCCTTCAAGACTGTCTTCGCTTCAAGTTCTTGTTAATTAGCAACGGCGGATCCATGTGAAATTACTAATCCACCCAAGTAAGTACTACTTGATTGTTCTGAATTCGTGGGTAGAACTATAACTTTTTTCCCCCCGGCCATGGTTAAATTTTCTAATTGATTGCGCCAACTAACTACTTTAATTTCACCCGAGA 4 1 5' arm Cichorium_intybus mirnest MIR167_1 0.000003 csi-MIR167c 0.0000002 -65.7 ......((.....((((.((((((((((((....((((.((((((..(((((((......((((((.(((...(((((.((.(((((((.(((...)))...)))).))).)).)))))..)))))))))......))))))).((...((...(((.((((.....))))...)))..)).))))))))))))....)))))))))))).)))).))......... (-65.7)