mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTTCTCTATCTGTCAGC TCACACCAGATTGAGAGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCTAGTGGTATTTGTATGAGGGCATACAATTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTATCTGTCAGCTTCCCATTCTTTTTTACT GGTTTCAGAGTTGAGACATTTGGGTCTCATTCATCAGAATTCAGAAAAGAGATCGATGGTTAATTGTTTGCAGTTGATGATGAAGAAAGGCTCACAAGAAATTGATGCAACAAAACATTGAATATCAATCCAAGAGAGGTTTCACACCAGATTGAGAGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCTAGTGGTATTTGTATGAGGGCATACAATTGCGGGTGCGTGCTCACTTCTCTATCTGTCAGCTTCCCATTCTTTTTTACTTTTGGTGTGTTCCTCTCATCTCTTCGTAACTTCACAACTCTTGAAGCGCCTCCTCAGTGTAACTCTCTTTTAACTTCATTCCATTCTCTGTGTTTTAAGTTTTCACACTCACTTTAAATAAGTCCCCTTTATGGTACAAACTTGTCTCATTCTCCGAGCAAGTCAATGGATCTATGTAATTATAGCCCTTGAAACGACTCGTATTGCATGATCCTTC 1 2 5' arm Glycine_max mirnest mir-156 0.00000000000003 gma-MIR156a 5e-65 -51.4 .......(((.((...(((((((((((((((((((((((((.((((....(((.(((((((....))))))).))).)))).)))))))).))))).)))))))))))).)).)))........ (-51.4)