mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCTCAGTTCAGCAGGAACAG GTGCCTGCTGTGCTGATAATCAGT GGGTCAGTCTCCTGTGCCTGCTGTGCTGATAATCAGTGTGTGACGTTGGCTGGCTCAGTTCAGCAGGAACAGGGGACTGG 3 2 3' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-24 9e-29 fru-mir-24-2 4e-40 -43.3 ....(((((((((((.(((((((.(((((...(((((...........))))).))))).))))))).))))))))))). (-43.30)