mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCAGTG CAGAGCTTAGCTAATTGGTGAGCA CTCTTGCTGAAGGCACAGAGCTTAGCTAATTGGTGAGCATTGATCCCTGCTATGTGTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCAGTGCC 3 2 3' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-27 6e-33 fru-mir-27e 6e-36 -32.87 ...........(((((.(((((((((((....(((((((..................)))))))..))))))))))).))))) (-32.87)