mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTAGCATCATCAAGATTCACA CAGATAGATTAACAGTCGTTATTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAGCGCAGGTGGTGGGTGGGACTTGATGCAATCTAAGTGCTGTGCCAGCCAAGCCATAGGTCTTTTGGAACTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTCACTTTAAAAA GAGAGTGAACAGTATGCTACATATAGCTTCTATATATATGTTACTTTGTTTTAGGAGCTATAGTTGCATGGACAGATAGATTAACAGTCGTTATTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAGCGCAGGTGGTGGGTGGGACTTGATGCAATCTAAGTGCTGTGCCAGCCAAGCCATAGGTCTTTTGGAACTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTCACTTTAAAAAGTTAGATAAGGACTATTCTAACCTCAACAAGTGGGCAAAAAAAAAAAACATAATGAAAAAACCAAAAACTGTTGTTGGGGGATACACACATGAGCATGGCACAGCCAAAACCTTGAGACATGATCTGATCTGTGCATTTAAACCAAGAGAGGTGGTGACCTTTCCCACTTTGCTTTTTGTTGGTGTCAGGTGGGTTTGTGTTTTTTTGCCCTTTGTTTTTCAATTTATGGTGTACTAATTTTTTATTTGTACTTTAATGGATATAGGTATGGCCTTGCA 1 0 3' arm Glycine_max mirnest mir-172 0.0000000002 gma-MIR172a 6e-87 -59.9 .............(((((((....((.(((((((((((((((((((((...(((....)))(((..(((.(((.((.....(((.......))).)).))).))).))).(((.(((...))).))).))))))))))))))))))))).))....)))))))............ (-59.9)