mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATAAAGTAGAAAGCACTACT TAGTGTTTCCTACTTTATGGA GTACAGTGCAGTCATCCATAAAGTAGAAAGCACTACTAAACTCTTCGCCACAGTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACTGTTG 2 0 5' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-142 1e-37 dre-mir-142a 3e-41 -47.37 ..((((((((.(((((((((((((((.(((((((((..................))))))))).))))))))))))))).)))))))).. (-47.37)