mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTATAGATGATGTACT GATATCATCTTATACTGTAAG CCCTGGACAGGATATCATCTTATACTGTAAGTTTAATAAAGTGACACTACAGTATAGATGATGTACTATCCAGG 1 1 3' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-144 5e-33 fru-mir-144 7e-29 -31.1 .((((((.((.(((((((((.((((((((.(((.........)))..))))))))))))))))).)).)))))) (-31.10)