mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAACAGCAACTCCATGTGG AGTGGAAGTGCTGTTACCTG GCGCGCTGGATGTAACAGCAACTCCATGTGGAAGCTGTATGTGTGTTCCAGTGGAAGTGCTGTTACCTGCAGAGATCCACC 3 1 5' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-194 2e-33 fru-mir-194 5e-33 -30.5 ...(.(((.(.(((((((((..(((((.(((((((.......)).))))))))))..))))))))).).))).)....... (-30.50)