mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG GTTGGTATTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAATGAGGTTCACAGTGGATGGAACTATAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAAGTTC GGGGGAAGAGTGTTGTGTTGAGATGGGTTGGTATTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAATGAGGTTCACAGTGGATGGAACTATAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAAGTTCTTCCTTTCATTTGTTTCTACTTCAAACTTCAAACACAAGATCATGTGTGTTGTGTGTGGTTGAGAACTTGACATGCTTCTTCTTCCTAGCTTGCAAAGGTGAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATGGAGGAGGAGGAGGAGTAGAGTACTGAGATCAGTGAAAGTTTCCAATGGAAATTTACCCTCTTACACAAAAAAATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCACCCAACTTTTGCTTTTTCCTTAATTTAAATTTCTTTCTCTTCTATTATTATTTTGTGTCTGATGTGTGTGTTTTAGTGTAATGTATTTATGGAGCTTCTAAAGTTGTTGAAAATGCAGAAACCAACTCAGGAAAAGCTTGGATCAGCAATATCAGCTTCATATGCTACCTTTTCGTG 2 2 3' arm Glycine_max mirnest mir-166 0.00000000000003 mtr-MIR166e 0.000000000000001 -44 .......((((((((((((..((((((.(((((((((((((....)))(((((.((.....)))))))..)))))))))).))).))).))))))))))))...... (-44)