mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTAGGGGCAGCTGT CAGCAAGAAAAGTGAGGGACTTTTAGGGGCAGCTGTGTTTTATTAACCCAGTCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCAATTGTC 4 1 3' arm Tetraodon_nigroviridis mirbase mir-365 3e-41 fru-mir-365 3e-47 -39.7 ..((((((..((((((((..(((((((((((((((.(((.....))).)))).....))))))))))).))))))))..))))))....... (-39.70)