mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATG TAAAGCTAGGTTACCAAAGATA TCATACTGACTCTGCTTTTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGATGTCAATGCATCATAAAGCTAGGTTACCAAAGATAAGTGCCTGTTGTCACATGT 6 0 5' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase mir-9 0.000000000000006 spu-mir-79 5e-52 -33.9 .(((..((((.(.((.(((.((((((((.((((((((......(((((((....)))))))..)))))))).)))))))).))).))..)..)))).))). (-33.90)