mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTCGTTGCATTGCAT GTAGTGCAAGAACAGTGCAATA ATCTCTTTCTTGTAGCCATGGTGCATTGTCGTTGCATTGCATCTTTCTCTATACCCCTATGTAGTGCAAGAACAGTGCAATATGGAGGCAAGATAAGCAGC 3 0 5' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase mir-33 5e-28 lgi-mir-33 0.00008 -39.89 ..(((((((((((..(((((.((((((((..(((((((((((................)))))))))))..)))))))).)))))..)))))).))).)). (-39.89)