mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACCAGGCTTCATTCCCGT GGGAATGTTGTTTGGCTCGAG AATGAGAGATTGGGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTAACTATGCATGGTCTTAATTTTGTTCATCTTTGAAGCTTTAATTTATGGGTTTCGATCTCTTTGATCCCTTGAAACAAAGAAAGCTTTAAAGGTTGGATTTTGAGGCTTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTAAACCTTATCTCTCTCT ATTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACTCGGGTTTGTGCTGAGAGAACCAAGGGTTTCTTCCCTTGCAGAGAAGAAAATTTGGTTCAGATCGAAAGTTATACATGCATGGTTTTATATATTGTTCTTTCATCTTTCTCAGATATGGTTCGAAATGAGAGATTGGGGTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTAACTATGCATGGTCTTAATTTTGTTCATCTTTGAAGCTTTAATTTATGGGTTTCGATCTCTTTGATCCCTTGAAACAAAGAAAGCTTTAAAGGTTGGATTTTGAGGCTTTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCGTAAACCTTATCTCTCTCTCTCTCTCTAGAGATCTTCTCCCATGGATGGCTTATGGTGGTAATTAATTAAGGTGATGCCAAAACAAGACTCTTGTGATAGTGCCTACTTGTCAATGATGAAGTTAACATTCCTCTTGTTTGTGTTTGTAAATTCAGACATTGCATGGGACAAAACTTGAAACATTTGTCAAAAACTCTGTTGAACAAGATGCCTTTGACCTTGTAGTTGGTGCTTTGTTTGTCATCTTTCTTATGGCTCCATTATACTTATATATCTTCATTTCTTTCAACACCTCTCTCGTGAGTTAATTTAACGGTTGGGACTTGAGATTTGTGCTAAAAGGATCAGGCTCCAAAATCTTTATATTTTTCTTGGATTATGATTAGTGAGTGATTGATATTAGTTTTTTTTAAGTTAAATAATATGCGTTGAGAAACCCAAGGAACTTTGAAATTTTGTATTTTGTCAGTATATAGGTTTCCCAGCTGTAGCATCTTTAGGGTTTGAGATTCGTAACCATCTTTACTTCCTGTCAAGTTTCAGTCCAAGTAGCTGGC 3 0 3' arm Glycine_max mirnest mir-166 0.000000003 mtr-MIR166b 0.0000000002 -72.4 ...((((((.(((((((.(((((((((..((((((.((((((...........((((((((....((((((((((((((((((..((((.(((..((((.....)))).))).))))......))))))))))))).))))).)))))))).)))))).))))))..))))))))).)))))))..)))))). (-72.4)