mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCGAACGCAATTCTTG AGAACTGTGTACGGACATCAGT TCCATGCGAGTGTTCTCCGTTGATTGTCCGAACGCAATTCTTGTTGAATTTCCTAGTCAAGAACTGTGTACGGACATCAGTGGTTGATACCGCTAGCACCT 2 1 5' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase mir-219 3e-32 dan-mir-219 0.00000008 -38.5 .....(((.(((((..((((((((.(((((.(((((.(((((((((.......))).)))))).))))).)))))))))))))..))))))))........ (-38.50)