mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTTCGTTCGGCTCGCGTCAA CGAGCTCAACGTGCAAAACTTGAGATAAGGTCAGCTGTTCGGCTGGCCGCTACATGCTGTTTTGTTCGTTCGGCTCGCGTCAAATTGCAGTCACACTATCC 8 0 3' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase mir-375 0.0003 lgi-mir-375 0.000005 -36.7 ((((((.((((.(((((((.((((....((((((((....)))))))).)).))....))))))).)))).))))))........................ (-36.70)