mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCAAGGTGTGCTAGTGATGAC AGTCACTACCACACCTTCGGTGG GCACCGTGCCTAGTCTCCCTGCAGTCACTACCACACCTTCGGTGGCTTTTTATAGCTTCACCAAGGTGTGCTAGTGATGACAGGGGGATGGGAACAATCA 3 1 3' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase 100 sko-mir-2011 0.0003 -52.1 .....((.((((.((((((((..(((((((.((((((((.(((((((......)))..)))))))))))).)))))))..)))))))))))).))..... (-52.10)