mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG CCATTTGGGACGGAAGCTTTGTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACCCTTCTTCATCTTGATCTTGTGTAGACTACTATGCTTGTGGTCAAGGAATACATAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATATGCTTCCAAATTCTTTTTC AAAAAAGGGCCATTTGGGACGGAAGCTTTGTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACCCTTCTTCATCTTGATCTTGTGTAGACTACTATGCTTGTGGTCAAGGAATACATAGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTATATGCTTCCAAATTCTTTTTCGACCGAAACCTTGGTATCCTCCGGCCGAGGACCAGAAACATACACCGAGATTCATCCGAGGTTTACATCTTTTAACAGATATTTTTTCTTACATTAAATACATACGGATGTATGGAATCAAACCATGACAACATAGTAACATACTAGGTTTATTGGTCTCCCACTCTCTATGTTTTTTTTTTGGGGGATTTTTGAATTAGTAATAAATTTTTGTTTTTTTCTTAAATATAGGTAGATCTGAGTCGTGGGGTTTTGTTTTTGGATGAATTAAAGATGTTGGTAGTTTGCAGATTGGTGTAATGATGAAGCATTTTGACCTGNGGGGTTTCACTTGTGCGCAAAAG 3 0 3' arm Glycine_max mirnest mir-166 0.00000000001 gma-MIR166a 3e-79 -57.6 ((....))...((((((..(((...(((.((((((((..((((((.((((.(((.((......((((((((..((((((....))))))....)))))))).......)).))).)))).))))))..)))))))).)))..))).))))))............ (-57.6)