mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTCCGTTGTTGCGTCTTGGTA CGATCGCGATGTCGTTAGCTTCC CGGGTCGATGAGGCGGTAGCTCCGTTGTTGCGTCTTGGTAGGCGGTGTGCGTTTGCGATCGCGATGTCGTTAGCTTCCCTTTCATTGATGCC 5 3 5' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirbase 100 100 -36.2 .(.((((((((((.((.((((.((.(((((((...(.(((((((.....))))))).).))))))).))..)))).)).)))))))))).). (-36.20)