mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATATGAAATCAGTTT ACTGGCTTTATTTGGTGCATGGA AGAATGTTGTTATAATGGGAGACTGGCTTTATTTGGTGCATGGAGTACACTTTCATCCTCTAGCACCATATGAAATCAGTTTTCCATAGTGACATT 3 1 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-29 0.00002 lgi-mir-29 0.000005 -41.1 .......((((((.(((((((((((..(((((.((((((.(((((............))))))))))).)))))..))))))))))).)))))).. (-41.10)