mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAAGCTAGGTTACCAAAGACA TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA CCGAATTTTTGGCTCTCGTTTTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTACATGACATTATAAAGCTAGGTTACCAAAGACAAAAACAGATGCCAGTGAT 4 0 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-9 0.00000000002 sko-mir-9 2e-39 -37.8 ....(((.((((((((.(((((.((((((((.((((((((.(((((.(((.....)))))))).)))))))).))))))))..)))))))).))))).))) (-37.80)