mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCCTAA AGGCCAGAATAAGAACAATGTT CTCATAACATGTCTGGGGACGCTCAGGCCAGAATAAGAACAATGTTGTGATGACAACAAATATTGCACTTGTCCCGGCCTAAGTGTTACAGTCACTATGGC 5 0 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-92 0.000005 bfl-mir-92a-2 0.0000003 -33.8 .(((((...((.(((..((((((.(((((.(.(((((..(((((((((.......)).)))))))..))))).).))))).)))))).))).)).))))). (-33.80)