mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA AGTGTTCACAGCGGTCCTTGAT GGATGGTTATGTCCTGTTCTAAGTGTTCACAGCGGTCCTTGATGTTCCACACAACGCAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAACAAAGATATATAAAAT 5 0 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-124 0.0000000004 bfl-mir-124 0.00000000002 -32.66 .......((((((.((((((..((((((((.(((..(((((((...............)))))))..))).))))))))..))))))..))))))...... (-32.66)