mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAAGTAGTAGTGCCGCAGGTAA ACCTGCTCTCTACTGCTTAACA TACATTGGTTCTTATCCTTGCTAAGTAGTAGTGCCGCAGGTAATTAAAATAATCATTTACCTGCTCTCTACTGCTTAACAAGGTATAACCAAAAATCATCG 3 1 5' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-252 0.00009 cte-mir-252b 0.00000002 -37.42 ....((((((..((.(((((.((((((((((.(..((((((((.............)))))))).).)))))))))).))))))).))))))......... (-37.42)