mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGATTGTTGCTCAGAAAG TTCGGGTAACAATTAAAAAT TCACATTGACTCTGGCGCCGTTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCCTTATGCTTCTGGTCGGCTTTCGGGTAACAATTAAAAATAGCGAGAGAGTTTTCATCTC 0 1 5' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase mir-315 0.000005 api-mir-315 0.0000003 -39.3 .......((((((..(((..(((((((((((((((.(((((((....((.....)).))))))))))))))))))))))...)))..))))))........ (-39.30)