mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCACACTACATAGCGGTGC ATCGCTATCGTGTGTTCTTGT ATGGAATTGAATGCATGTGCGGTATCATCGCTATCGTGTGTTCTTGTGTGTCTGTACAACAAGCACACTACATAGCGGTGCTTCCACGCACGTAAATCTA 2 2 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 100 -34.5 ...........(((.((((.((...(((((((((.((((((.((((((((....))).))))).)))).)))))))))))...)).)))).)))...... (-34.50)