mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCAGCCTCGCTGTCAATACGG GTATTAACACTGAGGTTGATGT TTCTTCATCTTTTACTCCGTATTAACACTGAGGTTGATGTTCGCAGTAACTAACCATCAGCCTCGCTGTCAATACGGCGTAACTGATGGTAG 2 0 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 spu-mir-2008 0.0000003 -37.06 ....(((((..((((.(((((((.(((.(((((((((((...............))))))))))).))).))))))).))))..)))))... (-37.06)