mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCAAGGTGTGTTAGTGATGAC GGTCACTGTCACACCTTAAGGTGT ATGTGTTTATTTCAATGCGGTCACTGTCACACCTTAAGGTGTCAAAATTAAATTACACCAAGGTGTGTTAGTGATGACATTGCAATAGAACTA 3 2 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 spu-mir-2011 0.0003 -34.4 .....((((((.(((((..(((((((.((((((((..(((((............))))))))))))).)))))))..))))).)))))).... (-34.40)