mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGCATGATGTAGTGGTGTG CATCGCTATTTCTTGCTGGCACC TGGAATATCTGCTCTTTACTGCACATCGCTATTTCTTGCTGGCACCATCTGATTAAAGGTGCAGCATGATGTAGTGGTGTGCAGTGGAGTAAATAAACA 2 1 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 spu-mir-2013 0.00007 -46.8 .....(((.((((((..(((((((((((((((.((.(((((.((((...........))))))))).)).))))))))))))))))))))).))).... (-46.80)