mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTGCACGCAATAGTGGGGTT CTCCATTATTGTATGCTATTAG AATGGTTTCTGTTTAGTTTGGATCTCCATTATTGTATGCTATTAGTGATGATACTGGTCTAATTGCACGCAATAGTGGGGTTCTTAACAAATACCCATCCT 4 0 3' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 100 -32.02 .((((....(((((.(((.(((.(((((((((((..(((.(((((.............))))).)))..))))))))))).))).)))))))).))))... (-32.02)