mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTTGAGTGCCATATGGAGGA CTCCTTATGCACCCCAGAGAC TAAGTCTGTTTTTGTCTCTTGAGTGCCATATGGAGGACAAAAGCGTTCTATTTCTCCTTATGCACCCCAGAGACAAAAACTAACATT 3 1 5' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 sko-mir-4830d 0.0003 -32.34 ...((..((((((((((((.(.((((.(((.((((((..............)))))).))))))).).))))))))))))..))... (-32.34)