mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCG GAGCTCTCTGCACTCCAGTGT AAACTCAAGTTGGAGCTCTCTGCACTCCAGTGTTGAAGGAGGTGATGGTAAACCCTAGCTGCTAATTCATGGTTACCTTTGGCTTCCCATAAGGAAGCATGTGAAAGTCATGGGTTTACATGAATATGGAGACGGGGTTGCCTTGATCTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCGAATTAGGCC GGATCACAATTCCCTCTTAACAATTGCATATATATTTGAGTAGTCCTTTTCTAGTTTAAACAATCAAGGATTTTGGGTATGAATAAACTCAAGTTGGAGCTCTCTGCACTCCAGTGTTGAAGGAGGTGATGGTAAACCCTAGCTGCTAATTCATGGTTACCTTTGGCTTCCCATAAGGAAGCATGTGAAAGTCATGGGTTTACATGAATATGGAGACGGGGTTGCCTTGATCTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCGAATTAGGCCTTCTTAACTAAATACTCACTTTATATATTATATGCATGGTTTCTGAAAAACGGTTTATCATTACAATTTAAACTGCAACATAAATATTTTTATTTTCTTATTGTGATTGTAAGTACGGTTACATCAGTTATATTTGTGTATACGTAATTTCTCGAAATTTTAATGATGGCAACAAAATATCAACTTCAACCACAATCTAATATAAACCTTAGATTATATATATGCATGTCATGCTTTCATGGTTGCAGGTGTTATGTTTCACACCCCTCTTTTCATGTGTTTCTCTTTTTTATTATTTTTTTTATCTTTTTAATTTCCATGACATCATTTTGTAAATTTTGTTTAGCTTATTTTCTAGTTCTTATCTCTCTCCCTTTTATGGGTGTATACCCACTTGGTATGAGAAATAATTATTTTCCTACATACATATGTTGCTAATCGCATGTTGCGGGGTTTTTCGAAAGGATTGGAAACCGAATAGGCGAGAAGAGTTGTTTTTGAATTGAATGAGACTGATCTTGTCAGGAACATCAACATGTTTCAACCTAGCTAAATCAAAGTGAGTGAGAAATGGAAAGGACGAGCCATCACTGAAAAGAGAAAAATGAAACAACAG 1 0 3' arm Glycine_max mirnest MIR159 0.000003 gma-MIR159c 4e-54 -72.4 ...((.((.((((((((((((.((((((((((((((((((..(((.(((((.((((..((.((((((((((...((((...((((((.....))))))..((((...))))))))...))))))).)))))..)))))))))))).)))))))))))))))))).)))))))))))).)).)).. (-72.4)