mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCGTGCTTCCTTACTTCCCATA TCCGTTCGGATCACCGTGCTTCCTTACTTCCCATATGTGTCCCCTCAGAGCGGTATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGTTCCGGTGGACGACA 5 0 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-1 8e-39 dpu-mir-1 0.0000003 -32 ..((((((((.(.(((((((((.((((...((((((.((..(.....)..))))))))...)))).))))))))).).))))...))))... (-32.00)