mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCGTCAAAGTGGCTCTGATGTG TTTCGTAGACGTCCCACCTCTGTTCGTCAAAGTGGCTCTGATGTGTGTCTCTTTTTTTCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCGGTGGTGAGTCTCCTACT 1 1 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-2 4e-19 dpu-mir-2a 0.00000002 -46.92 ....((((..(.(.((((.((((((((((((((((((.(((((((.............))))))).))))).))))))))))))).)))).).)..)))). (-46.92)