mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCACCTTTGATGAGC CGTCAAAGGGACTGTGAAATG CTAATGTTTTCCTGTGCAGCCGTCAAAGGGACTGTGAAATGTCTCCCTTCTTGGTCAGCATATCACAGCCACCTTTGATGAGCTGTACACGAATCGGACTC 2 2 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-2 5e-34 dwi-mir-2a-1 0.0000003 -43.1 .....((((((.((((((((((((((((((.((((((.((((...((.....))...)))).)))))).).))))))))).)))))))).)))...))).. (-43.10)