mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTCAGGTAAAGATGTC CATCTTACCAGACAGCATTAGA CAGCGACCGAGCACCCGTCAACATCTTACCAGACAGCATTAGATTGAGCCTGATTTCTAATACTGTCAGGTAAAGATGTCCGCGGGAACGCTGT 3 1 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-8 7e-36 dpu-mir-8 0.00000000007 -36.9 (((((........(((((..((((((((((.(((((.((((((............)))))).))))).))).)))))))..)))))..))))). (-36.90)