mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAATGTGTTGTGTTTGTGAG TTGTTAAGCGCAGCGAGTTTTAG GACTCCTTTTATCATTCTGTTTTAATGTGTTGTGTTTGTGAGAACCCCTGATTACATTTTTGTTAAGCGCAGCGAGTTTTAGGGCTTAAAAAAAAAAAAA TGGTGATGCTGGTTTTGTTAAGATGATTCCGACCAAACCCATGGTGGTTGAAACTTTCTCTGAGTACCCCCCACTTGGTCGCTTTGCTGTCAGGGATATGCGTCAAACTGTTGCTGTGGGAGTCATCAAGAACGTGGAGAAGAAGGATCCTACTGGAGCCAAGGTCACCAAGGCTGCCCAGAAGAAGAAGTGAATCGTGCGGTTTGGTTCATCAGGGGATGTCGTTTCTTATGGTTACAATAAATGTTGGTTTCTTGCCCTTGTGTCTTCGTTTCTAGGTAGCTTGTTTTTCGGACATAGTTTGAAGTCTCCACCATCATCTCGCAACTTTTGTTCCCAGAATTGGGTTCTTGATCGACGGTGGCAAGACTCCTTTTATCATTCTGTTTTAATGTGTTGTGTTTGTGAGAACCCCTGATTACATTTTTGTTAAGCGCAGCGAGTTTTAGGGCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 2 5' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR2108b 3e-32 -16.4 ......(((((...(((((....(((.(((((((((((.((((.............))))...))))))))))).))).)))))..)))))......... (-16.4)