mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGATTTTCGTCCGTTT CCGGATGAATTTCTCGCCTGGCC TGCATTATAGGCTCTGATGTGTCCGGATGAATTTCTCGCCTGGCCGTTTCCGGTCCCCCGGAACAGGTCGGTGGGATTTTCGTCCGTTTACGTCAGGCCTACA 4 1 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-278 2e-49 dpu-mir-278 0.00002 -61.4 .......(((((.((((((((..((((((((..(((((((.((((..((((((....))))))..)))))))))))..))))))))..))))))))))))).. (-61.40)