mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATCCA GATGACTGTGCCTCTAGTCCATG CCTATCGTTGCTATTGATGACTGTGCCTCTAGTCCATGTGAATCTAGCTCATGACTAGATCCACACTCATCCATAGAAGCGGAACTTTGTCG 4 1 3' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-279 2e-39 lgi-mir-279 0.0000000003 -30.7 ....(((((.((((.(((((.((((..(((((((.(((.(.......).))))))))))..)))).))))).)))).))))).......... (-30.70)